Насколько я помню, при комбинативной изменчивости в результате слияния родительских гамет возникают новые комбинации генов, однако сами гены и хромосомы остаются неизменными. То есть, хотя число разнообразных комбинаций генов очень велико, но новых популяций, подвидов или видов при этом не образуется.
А при мутационной изменчивости происходят изменения в самом генотипе. Меняются отдельные гены, изменяется строение хромосом и их число. И в результате мутаций могут возникать полезные признаки, которые в результате естественного отбора дают начало новым подвидам и видам.
Повторю: в этом лучше Элейна разбирается. Подождем-с?