Будем спорить, от кого произошли орки? Будем спорить, есть ли фэа у орков? Ага, сейчас...
А про то, нужно ли уничтожать орков, сказано ясно: " For a while his Orcs and Dragons breeding again in dark places troubled and affrighted the world, as in far places they do yet; but ere the End all shall perish by the valour of mortal Men." (Квэнта Нолдоринва, глава 19). Ясно, да? Доблестью Смертных все орки будут перебиты.
Хотя опять же, можно найти и противоположное мнение (сдающихся надо щадить, даже если это орки). Однако факт есть факт - ко времени "Новой тени" все орки, похоже, были перебиты, и героев этого неоконченного произведения это, видимо, весьма радовало.