Ну, я так поняла, что как раз по причине разделенности души Вольдеморт в тот момент не умер, а только "развоплотился" (вот как Саурон, когда его от Кольца отделили
). Поэтому позже он "подселился" к Квирелу и т.д. То есть "главная" часть в принципе "неубиваема", пока все остальные где-то существуют.