Ну, дыма без огня не бывает. Раз CD-ROM'ы исчезли, значит, всё-таки что-то задел. Возможно, имело место быть банальное сотрясение при возне с крышкой.
Попробуй вытащить и вставить обратно шлейфы и разъёмы питания (при выключенном компе, разумеется) - это первое, что приходит в голову. Скорее всего, этим всё и ограничится.
Занятный вопрос: если ты там внутри ничего не делал, то зачем ты вообще открывал крышку?